従来は、胃腸症状として、「慢性下痢」・「消化不良」・「胃腸内異常発酵」・「制酸」・「胃酸過多｣に有効とされてきました。これらについての疑問が国民生活センターから出されたことを契機に、厚生省（現厚生労働省）の要請に基づいて平成5 (1993) 年に第三者研究組織として組織された「アルカリイオン整水器検討委員会（委員長 糸川嘉則京都大学医学部衛生学教授）」によりアルカリイオン水の安全性と有効性に関する再検証が5年にわたって実施されました。
その結果、二重盲検試験を含む厳密な比較臨床試験（飲用水としては世界初）により、「アルカリイオン水は軽度の胃腸症状の改善に有効」との結論が示され、厚生省に報告書が提出されました（平成11（1999）年）。